زمینه و هدف: در مطالعات علوم پزشکی مکررا با داده های طولی که در طول زمان جمع آوری می شوند برخورد می گردد. زمانی که مدل سازی میانگین حاشیه ای هدف اصلی مطالعه است و ساختار همبستگی به عنوان یک پارامتر مزاحم در نظر گرفته می شود، معادلات برآوردی تعمیم یافته مرتبه اول (GEE1) معمولا یک راه حل مناسب پیشنهاد می کند. اما زمانی که مدل سازی ساختار همبستگی یکی از اهداف تحلیل است، معادلات برآوردی تعمیم یافته مرتبه دوم (GEE2) می تواند انتخاب اول برای تحلیل داده ها باشد. به همین جهت هدف از این مطالعه معادلات برآوردی تعمیم یافته مرتبه اول و دوم و کاربرد آن در تحلیل داده های طولی ریزنشت می باشد.روش بررسی: این مطالعه از نوع طراحی مدل آماری است. در این مقاله، روش های GEE1 و GEE2 در داده های به دست آمده از مطالعه ریزنشت دو ماده پرکننده انتهای ریشه دندان شاملMTA و CEM با دو ارتفاع و دو قطر مختلف و همچنین در سه نوبت تکرار (روز اول، هفته اول و ماه اول)، مورد استفاده قرار گرفتند و نتایج این دو روش آماری، در داده های کمی و دو حالته (وجود یا عدم وجود) ریزنشت مقایسه شدند.یافته ها: نتایج حاصل از GEE1 و GEE2 در داده های میزان ریزنشت نشان داد که زمان، نوع ماده پرکردنی، قطر و ارتفاع ماده پرکردنی اثر معنی داری بر میزان ریزنشت دارند. همچنین نتایج داده های دو حالته ریزنشت توسط دو روش آماری فوق، معنی داری زمان و نوع ماده پرکردنی را اثبات کردند. همبستگی بین تکرارها در داده های پیوسته غیرمعنی دار و در داده های دوحالتی معنی دار بود.نتیجه گیری: با توجه به اینکه در داده ها میزان ریزنشت، همبستگی بین تکرارها معنی دار نشد و برآوردهای حاصل از دو روشGEE1 و GEE2 یکسان شدند، در نتیجه در این داده ها روش ساده تر GEE1 کفایت می کند. اما از آنجا که در داده های دو حالته ریزنشت، رابطه بین تکرارها معنی دار گردید، بهتر است از روش GEE2 استفاده شود تا ساختار همبستگی به طور کاراتری برآورد گردد.